Мишел Мичомберо започва кариерата си като армейски капитан, а след време става министър на отбраната на Бурунди. През 1966 повежда контра-преврат и в крайна сметка става министър-председател на страната, като по това време той е едва на 26 години. Това е опасна длъжност - от както Бурунди става независима от Белгия държава през 1962 г. двама от неговите предшественици на този пост са убити.
Мичомберо премахва монархията и прогонва 19-годишния крал. Бидейки от племето Тутси, Мишел Мичомберо раздава властови постове изключително на хора от този етнос. Това води до напрежение с друга голяма етническа група - Хуту.
През 1972 Мичомберо потушава бунт на Хуту като избива между 150 000 и 300 000 души.
Макар Мишел Мичомберо да е свален през 1976, но посетият по негово време конфликт между Тутси и Хуту продължава и води до гражданската война водена между 1993 и 2005.